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学院前身为1983年原大理医学院的卫生学教研室。2002年招生首届预防医学本科生，2003年与云南省地方病防治所产学研合作共建“预防医学系”，2004年更名为“公共卫生学院”，同年招收流行病与卫生统计学硕士研究生。

学院设三办、团委、组织员办。有7个党支部，154名党员（教师党员31名/学生党员123名）。设有流行病与卫生统计学、劳动与环境卫生学、营养与食品卫生学、卫生检验与检疫、食品质量与安全5个教研室和1个实验教学中心。

学院现有公共卫生与预防医学（2021年）、公共卫生硕士（MPH，2018年）2个一级学科硕士学位授权点。拥有预防医学（医学，五年，公卫执业医师，2002年）、卫生检验与检验（理学，四年，2005年）、食品质量与安全（工学，四年，2015年）3个本科专业。

学院率先与云南省地方病防治所校所合作，与万博体育3.0手机版第六附属医院（昆明市第三人民医院）、云南省疾病预防控制中心 “2+2+1”联合培养预防医学人才，闯出一条产-学-研发展之路。学院拥有硕士生导师104人（校内13人，校外91人），形成了校内外联合培养的硕士生导师队伍，为高层次人才可持续培养奠定基础。

学院现有教职员工41人，其中专任教师34人（含在读博士1人），管理人员7人；其中教授5人，副教授（副高级职称）9人，博士学位的教师13人，云南省“万人计划”名医1人，云南省中青年学术和技术带头人 2 人，云南省卫健委医学领军人才1人和医学学科带头人 2 人以及大理州“苍洱霞光”人才1人，校级中青年学术带头人2人。

学院拥有 “云南省高校重点实验室”1个、“云南省高校创新团队”1个、“上海浦东-大理卫生发展研究中心”、“突发公共卫生事件应急处置实验教学平台”和“万博体育3.0手机版预防医学研究所”等教学科研平台。拥有“自然疫源性疾病流行病学研究”、“人兽共患病跨境防控及检疫”、“大理高原植源性食品资源开发与利用” 3个校级创新团队。拥有云南省研究生联合培养创新基地1个，省级优势特色重点建设学科1个，省级一流本科专业建设点2个，省级研究生导师团队1个、省级专业学位研究生教学案例库建设项目3项，省级研究生优质课程2门。

近5年学院获国家基金项目15项，包括2020年立项资助3项，其中 NSFC-云南联合基金重点项目实现了万博体育3.0手机版国家基金重点项目零的突破。2022年申报国家、教育部级别课题及平台13项，立项资助3项。

学院以解决长期威胁云南边疆民族地区公共卫生安全的新发、再发和高发疾病与环境危害防控为目标，应用基因组学、蛋白质组学、微生物组学、分子细胞生物学、生物信息学的交叉融合理论与技术方法，从组织器官、细胞、基因乃至代谢物水平等开展多维度、多尺度研究，形成三个特色优势方向。（1）流行病与卫生统计学：针对鼠疫、艾滋病、血吸虫病和地方病等云南高发疾病，聚焦疫源地调查、疾病分布、宿主动物和媒介、防控等方面的研究，明确疾病传播机制和流行规律，提升云南传染病和地方病防控能力和水平，为有效监测、防控疾病作出重要贡献。（2）营养与食品卫生学：围绕滇西高原食品营养与健康研究，创建地参等植源性食品酚类提取、成分分析、营养活性检测系列方法，探明其抗氧化、DNA损伤保护、肝损伤保护的作用及机制，有力推进滇西特色资源产品开发和应用。（3）卫生检验学：围绕云南影响重大的病原体、成矿带重金属污染健康效应开展研究，以汉坦病毒、冠状病毒等病毒致病性为研究特色，首次在我国发现并命名泸西病毒、福贡病毒和新型戊肝病毒，被国际病毒分类委员会（ICTV）认可和NCBI数据库收录。

至今为国家招收4438名（本科生3940名，研究生498名），培养了3062名公共卫生人才（本科生2781名，研究生281名）。培养的人才80%在云南边疆民族地区工作，为云南公共卫生安全提供智力支持和人才保障。目前在校生1376名，其中本科生1159名（留学本科生2名），研究生217名（其中学术学位 73名，专业学位 144名，其中留学生2名）。